Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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