Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDCSPQ8NFU4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms