Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIEQ8NEW7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms