Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms