Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms