Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR88Q6ZMY6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms