Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms