Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms