Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms