Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms