Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms