Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms