Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF123Q5XPI4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms