Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms