Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms