Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC39A12Q504Y0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms