Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms