Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms