Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC57Q2TAC2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms