Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms