Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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