Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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