Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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