Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms