Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP4Q15650 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms