Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms