Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms