Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms