Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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