Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCM1Q15154 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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PCM1Q15154 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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PCM1Q15154 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PCM1Q15154 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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PCM1Q15154 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCM1Q15154 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCM1Q15154 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCM1Q15154 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCM1Q15154 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCM1Q15154 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCM1Q15154 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCM1Q15154 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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