Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME4Q14997 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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