Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NR1D2Q14995 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NR1D2Q14995 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms