Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPARCL1Q14515 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPARCL1Q14515 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms