Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IKBKEQ14164 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKBKEQ14164 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms