Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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ATRQ13535 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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