Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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