Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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