Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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