Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATMQ13315 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms