Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLAMF1Q13291 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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