Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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