Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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