Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PRKAA1Q13131 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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