Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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