Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFX1Q12986 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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