Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PTP4A2Q12974 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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