Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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TRAF2Q12933 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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TRAF2Q12933 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF2Q12933 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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