Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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