Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STX4Q12846 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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