Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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